在服务器上更新代码时，有时可能会出现权限变了，日志没有写进去的问题。这可能是由于以下几个原因：

1. 使用了非标准的权限模式。在Linux中，Git默认使用--all模式，这意味着所有用户都有写入和执行文件的权利。如果你想只让某些用户有写入和执行文件的权利，你可以使用--groupadd和--force选项，但这样可能会导致权限变化。

2. 使用了错误的配置。例如，如果你的配置文件中没有正确地设置文件的权限，那么Git可能无法正确地设置权限。

3. 使用了不正确的命令。例如，如果你的命令是git add .，而你没有使用--force选项，那么Git可能无法正确地添加文件，或者添加的文件可能没有被添加到tree中。

要解决这些问题，你可以按照以下步骤进行操作：

1. 确保你的配置文件中正确地设置了文件的权限。你可以使用--setopt选项来设置文件的权限。

2. 使用--groupadd和--force选项来让你的用户具有写入和执行文件的权利。例如，你可以使用以下命令：

git add . git groupadd your_group_name git force add .

在这里，your_group_name是你想要给用户分配的组名。

1. 如果你的命令是git add .，而你没有使用--force选项，那么Git可能无法正确地添加文件，或者添加的文件可能没有被添加到tree中。在这种情况下，你需要使用--force选项来强制Git执行你的命令。

2. 如果以上步骤都无法解决问题，那么可能需要查看你的~/.gitconfig文件，看看是否有关于文件权限的配置。例如，你可以使用以下命令：

cat ~/.gitconfig

在这里，~/.gitconfig是你的用户的~/.gitconfig文件的路径。

1. 如果你仍然无法解决问题，那么可能需要查看你的服务器的/etc/ssh/sshd_config文件，看看是否有关于文件权限的配置。例如，你可以使用以下命令：

cat /etc/ssh/sshd_config

在这里，/etc/ssh/sshd_config是你的服务器的/etc/ssh/sshd_config文件的路径。