在JavaScript中，__proto__是一个对象的内部属性，它指向该对象的原型（即构造函数的prototype属性）。而prototype是函数（尤其是作为构造函数时）的一个属性，它用于实现基于原型的继承。

因此，当一个函数被用作构造函数创建实例对象后，该实例对象的__proto__指向构造函数的prototype。也就是说，对于由构造函数Foo生成的新对象obj，以下情况成立：

```javascript function Foo() {} var obj = new Foo();

// 这时候 obj.proto 指向 Foo.prototype console.log(obj.proto === Foo.prototype); // 输出：true ```

所以，问题中的“哪种情况下__proto__和prototype的指向是同一个”，严格来说，它们永远指向不同的对象，只不过__proto__指向的对象与某个构造函数的prototype属性指向的对象相同。