我想把文件一行一行地读出来存入到ArrayList中，countChar是计算文件中的字符个数用的。countChar的结果是对的，可是我在while循环里面逐行打印字符串s后发现，只打印了文件的后半部分，前半部分没有打印出来。照理说countChar的结果是对的，那s就是有读到文件的每一行，那为什么到打印的时候就只有文件的一部分呢？

private void parse(File dir, int n) throws Exception{
        File[] files = dir.listFiles();
        for (File file : files) {
            if (file.isDirectory()) {
                parse(file, n + 1); // 递归
            }else {
                if (file.getName().toLowerCase().endsWith(".java")) {
                    this.numberOfJavaSourceFiles++;
                     FileReader reader = new FileReader(file);
                     BufferedReader br = new BufferedReader(reader);
                     list.clear();//在收录文件前先清空list
                         String s = br.readLine();
                         //System.out.println("汪汪汪汪汪汪无无无无无无无无无无无无无");
                         while(s!=null) {
                           countChar = countChar+s.length()+1;//字符个数就是字符长度
                           //System.out.println(s);
                           list.add(s);//list存的是单个文件
                            s = br.readLine();
                         }
                         br.close();
                }
            }    
        }
    }

完整代码

package counter;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.FileReader;
import java.io.File;
import java.util.ArrayList;
public class AnalysisFileNumber {
    private int numberOfJavaSourceFiles;
    private File directory;
    //private long totalSize;
    private int noteNumber;
    private int charInNoteNumber;//注释中的字符数
    private int countChar;//所有文件的字符数
    private ArrayList<String> list;
    //private String s;

    public AnalysisFileNumber(File directory) throws Exception{
        this.directory = directory;
        list=new ArrayList<String>();
        this.parse(directory, 1);
    }
    
    private void parse(File dir, int n) throws Exception{
        File[] files = dir.listFiles();
        for (File file : files) {
            if (file.isDirectory()) {
                parse(file, n + 1); // 递归
            }else {
                if (file.getName().toLowerCase().endsWith(".java")) {
                    this.numberOfJavaSourceFiles++;
                     FileReader reader = new FileReader(file);
                     BufferedReader br = new BufferedReader(reader);
                     list.clear();//在收录文件前先清空list
                         String s = br.readLine();
                         //System.out.println("汪汪汪汪汪汪无无无无无无无无无无无无无");
                         while(s!=null) {
                           countChar = countChar+s.length()+1;//字符个数就是字符长度
                           //System.out.println(s);
                           list.add(s);//list存的是单个文件
                            s = br.readLine();
                         }
                         br.close();
                         
//                         for(int i=0;i<list.size();i++) {
//                             System.out.println(list.get(i));
//                         }
                    
                    AnalysisNoteNumber ann =new AnalysisNoteNumber(list);
                    
                    this.noteNumber+=ann.getCountNote();//获取注释数
                    this.charInNoteNumber+=ann.getCharInNote();//获取注释中的字符数
                    list.clear();
                    list.addAll(ann.getList());//此时的list是文件中除注释和输出语句外的部分
                    
                    //查找list中的关键字
                    AnalysisKeyNumber akn=new AnalysisKeyNumber(list);
                }
            }    
        }
    }
    
    public int getNumberOfJavaSourceFiles() {
        return numberOfJavaSourceFiles;
    }
    
    public long getCountChar() {
        return countChar;
    }
    
    public int getNoteNumber() {
        return noteNumber;
    }
    
    public int getCharInNoteNumber() {
        return charInNoteNumber;
    }
}