rsync命令在同步文件时，如果希望删除目标目录中源目录不存在的文件或目录，需要加上--delete选项。但有时--delete选项可能不会生效，这通常有以下几种常见原因：

1. 没有使用 -a 选项：-a 代表归档模式，它会保持符号链接、文件权限、时间戳等，并且和 --delete 结合使用时才会删除目标端多余的文件。所以正确的用法是： bash rsync -av --delete source/ destination/

2. 使用了 --delete-after 或 --delete-delay：这两个选项会在同步完成后才执行删除操作，看起来像是没有生效，但实际上是在同步完成后进行的。

3. 权限问题：检查运行rsync命令的用户是否有权限删除目标目录下的文件。

4. 避免意外删除：如果你之前在运行rsync时添加了 --dry-run（模拟运行）或者 --no-delete 选项，那么即使指定了 --delete，也不会实际删除任何文件。

5. 目标目录是 NFS 或者其他网络挂载的文件系统，且该文件系统的属性不支持删除操作。

6. 若目标目录是一个备份目录，部分备份软件可能会对其中的文件设置特殊保护属性，阻止了rsync的删除操作。

请根据上述情况排查你的问题所在。如果问题依然存在，请提供更详细的信息以便于进一步分析。